Programas de contabilidad para pymes y autónomos
Cumplir con las obligaciones fiscales y legales es clave para cualquier empresario. Para ello es fundamental llevar las cuentas al día y mantener toda la documentación digitalizada y bien organizada. Hoy en día existen numerosos programas de contabilidad, tanto gratuitos como de pago, en la nube o de instalación local, que se integran en muchos casos con otras herramientas para facilitar tareas como la facturación o la gestión de almacenes. A esto se suman los nuevos requisitos de facturación: Verifactu y la factura electrónica entre empresas.
Antes de elegir un software, analiza las necesidades de tu negocio y las funciones que más te convienen.
Los mejores programas de contabilidad: tabla comparativa
En la siguiente tabla encontrarás los programas de contabilidad y facturación que presentamos en este artículo, con sus características más importantes para tener un primer contacto y orientarte. Toda la información corresponde a octubre de 2026.
| Programa | Público | Funciones | Plataforma | Versión de prueba | App móvil | Verifactu | Precio |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Holded | Pymes y autónomos | Contabilidad, facturación, inventario, CRM | Nube | Sí (14 días) | Sí | Sí | € |
| Quipu | Autónomos y pymes | Facturación, previsión de impuestos, conciliación bancaria (según plan) | Nube | Sí (15 días) | Sí | Sí | €€ |
| Contasimple (by Shine) | Autónomos y pequeñas empresas | Facturación, contabilidad, impuestos | Nube | Plan gratuito; 30 días del plan Ultimate | Sí | Sí | Plan gratuito / € |
| Anfix | Autónomos y pymes | Facturación, tesorería, gestión bancaria, impuestos | Nube | Sí (15 días) | Sí | Sí | € |
| Billin (TS Facturas) | Autónomos y pequeñas empresas | Presupuestos, facturas, albaranes, stock | Nube | Sí (30 días) | Sí | Sí | € |
| Sage 50 | Pymes y autónomos | Contabilidad, facturación, gestión comercial | Local (desktop) y nube | Consultar | Sí | Sí | €€€ |
| Contasol | Pequeñas empresas, autónomos y asesorías | Contabilidad, impuestos, tesorería | Local (Windows) y nube | Sí (30 días) | No indicada | Sí | €€ |
| a3ERP Contabilidad | Pymes y asesorías | Contabilidad, facturación, almacén, clientes (según el proveedor) | Consultar | Consultar | Consultar | Consultar | Solo por cotización (sin precio público) |
Precio: € = hasta 15 euros al mes, €€ = de 15 a 30 euros, €€€ = más de 30 euros. La escala se refiere al plan de pago más económico, al precio de lista sin IVA y sin promociones (si el proveedor no ofrece pago mensual, se ha usado el importe mensual equivalente del pago trimestral o anual). “Solo por cotización (sin precio público)” significa que el proveedor no publica ningún precio y que las condiciones deben solicitarse directamente. “Consultar” significa que el dato no figura de forma verificable en la web del proveedor y debes comprobarlo allí. Un plan gratuito se indica expresamente. Los precios y el contenido de los planes cambian: compruébalos siempre en la web del proveedor. Los niveles de precio son solo una orientación: se basan en los precios de lista en el momento de la redacción y pueden variar según el período de facturación, el número de usuarios o el IVA, por lo que conviene consultar la oferta actual del proveedor.
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Verifactu y factura electrónica: lo que debes saber
Dos novedades normativas afectan a la elección de tu programa de contabilidad y facturación. Los plazos de Verifactu ya se han modificado y Hacienda ha anunciado un posible nuevo aplazamiento, por lo que conviene comprobar siempre el estado actual en la web de la Agencia Tributaria (AEAT) y en el BOE.
- Verifactu (Real Decreto 1007/2023): regula los sistemas informáticos de facturación. El Real Decreto-ley 15/2025, publicado en el BOE el 3 de diciembre de 2025, modificó los plazos: los contribuyentes del Impuesto sobre Sociedades deben tener adaptados los sistemas informáticos antes del 1 de enero de 2027, y el resto de obligados (entre ellos, los autónomos que tributan por IRPF por actividades económicas, los establecimientos permanentes de no residentes y las entidades en atribución de rentas con actividad económica) deben tenerlos operativos antes del 1 de julio de 2027.
- Posible nuevo aplazamiento: el 5 de octubre de 2026, el Ministerio de Hacienda publicó una nota informativa sobre la previsión de aplazar hasta octubre de 2028 las obligaciones pendientes de aplicación del Real Decreto 1007/2023, para hacerlas coincidir con la obligatoriedad de la factura electrónica para empresarios y profesionales cuya facturación anual no supere los 8 millones de euros. Según la propia nota, la medida se abordará una vez aprobada la alineación de los calendarios. A 8 de octubre de 2026 no hemos encontrado ninguna disposición publicada en el BOE que la recoja, por lo que las fechas del Real Decreto-ley 15/2025 siguen siendo las que constan en el BOE. Consulta siempre el estado actual en la AEAT y en el BOE.
- Factura electrónica entre empresas (Ley 18/2022): el Real Decreto 238/2026, de 25 de marzo (BOE del 31 de marzo de 2026), desarrolla la obligación de facturación electrónica entre empresarios y profesionales. Su aplicación efectiva se cuenta desde la entrada en vigor de la orden ministerial que regula la solución pública de facturación electrónica: doce meses después para quienes hayan superado los 8 millones de euros de volumen de operaciones en el año natural anterior y veinticuatro meses después para el resto de empresarios y profesionales. Esa orden, la Orden HAC/1028/2026, de 2 de octubre, se publicó en el BOE el 5 de octubre de 2026 y entra en vigor al día siguiente de su publicación (6 de octubre de 2026). Ni el real decreto ni la orden fijan fechas de calendario concretas.
- Facturae y FACe: según Facturae.gob.es, desde el 15 de enero de 2015 las facturas dirigidas a las administraciones públicas deben ser electrónicas y ajustarse al formato estructurado Facturae (versión 3.2.x) con firma electrónica XAdES (Ley 25/2013). FACe es el Punto General de Entrada de Facturas Electrónicas de la Administración General del Estado.
- TicketBAI (País Vasco): las Haciendas Forales vascas y el Gobierno Vasco han impulsado el sistema TicketBAI, que impone obligaciones legales y técnicas a los programas de facturación de los contribuyentes sujetos a su normativa (según la Diputación Foral de Gipuzkoa). Si tu actividad está sujeta a normativa foral vasca, consulta con tu Hacienda Foral.
- Conservación: según el artículo 30 del Código de Comercio, los empresarios deben conservar los libros, la correspondencia, la documentación y los justificantes concernientes a su negocio durante seis años a partir del último asiento realizado en los libros, salvo lo que se establezca por disposiciones generales o especiales.
Si un proveedor indica que su programa es compatible con Verifactu, se trata de una afirmación del propio fabricante. Comprueba en cada caso que el programa se ajusta a la normativa vigente y consulta a tu asesor o gestor.
El software de contabilidad: qué es y qué hace
El software de contabilidad ayuda a los empresarios a llevar las cuentas de su negocio al día para que puedan cumplir con sus obligaciones formales y fiscales. Según el proveedor, muchos programas utilizados en España siguen el Plan General de Contabilidad (PGC) y ayudan a preparar la información que se presenta a la AEAT. Por ello suponen una ayuda de gran valor para llevar la contabilidad en orden.
Diversos fabricantes de software, también del área hispanohablante, se han especializado en los llamados sistemas ERP (Enterprise Resource Planning), programas que reúnen diversas funciones de gestión de recursos –o permiten integrarlas en módulos– y que, además de la contabilidad, pueden gestionar inventarios o facturación.
Tipos de programas de contabilidad disponibles en el mercado
La oferta de software de contabilidad es amplia y variada, ya que cada negocio tiene necesidades específicas. Además, la evolución tecnológica ha impulsado las soluciones en la nube, que permiten gestionar la contabilidad desde cualquier dispositivo sin necesidad de instalación, una ventaja clave para autónomos y pequeñas empresas con movilidad.
Algunos programas ofrecen paquetes cerrados con funciones predefinidas, mientras que otros permiten integrar módulos adicionales o conectarse con otros sistemas, adaptándose mejor a diferentes tipos de actividad.
Si ya tienes experiencia en gestión contable, probablemente sepas qué funciones necesitas. Sin embargo, si estás buscando tu primer software, la cantidad de opciones puede resultar abrumadora.
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Factores clave que debes considerar
✓ Funcionalidad: ¿necesitas solo contabilidad o también facturación, gestión de inventario o impuestos?
✓ Verifactu y factura electrónica: ¿el programa indica que cumple Verifactu y puede emitir y recibir facturas electrónicas (por ejemplo, Facturae para la Administración)?
✓ Plataforma: ¿prefieres un software en la nube o de instalación local?
✓ Escalabilidad: ¿el software cubrirá tus necesidades a largo plazo?
✓ Número de usuarios: ¿lo utilizarás solo tú o tu equipo?
✓ Precio: ¿prefieres una opción gratuita o te puedes permitir pagar una cuota mensual?
Si eres autónomo o gestionas una pyme, responder a estas preguntas te ayudará a elegir la mejor opción para tu negocio.
¿Es mejor un programa de contabilidad de instalación local o en la nube?
Muchos programas de contabilidad están disponibles en versión local, en la nube o en ambas, y cada opción tiene sus ventajas e inconvenientes.
Software de contabilidad con instalación local
✓ Mayor control sobre los datos, ya que se almacenan en tus propios equipos o servidores.
✓ Puede funcionar sin conexión a Internet.
✗ Requiere que te encargues de las actualizaciones, mantenimiento y seguridad.
✗ Puede ser menos flexible si necesitas acceder a los datos desde distintos dispositivos o ubicaciones.
Software de contabilidad en la nube
✓ No requiere instalación y permite el acceso desde cualquier dispositivo con conexión a Internet.
✓ Actualizaciones y mantenimiento a cargo del proveedor.
✓ Copias de seguridad habituales y actualización normativa a cargo del proveedor.
✗ Dependencia de la conexión a Internet para su uso.
✗ Los datos se almacenan en servidores externos, por lo que es clave elegir un proveedor con altos estándares de seguridad y protección de datos.
Elegir entre una opción u otra dependerá de tus necesidades. Si buscas flexibilidad y acceso remoto, la nube es la mejor opción. Si prefieres mayor control sobre tus datos y no dependes de la movilidad, un software de instalación local puede ser más conveniente.
¿En qué se diferencian los programas de contabilidad para pymes y para autónomos?
Las necesidades contables de una pyme y un autónomo pueden ser muy distintas, ya que sus obligaciones fiscales y el nivel de detalle que requieren en la gestión de sus cuentas varían según la forma jurídica y el régimen en el que tributen.
Las pymes que se constituyen como sociedades suelen necesitar una contabilidad más completa, con informes financieros, gestión de inventarios, varios usuarios y una buena relación con su asesoría. Por ello, los programas de contabilidad para pymes suelen ser más completos y avanzados.
Los autónomos tienen normalmente una gestión contable más sencilla, aunque sus obligaciones dependen del régimen en el que tributen. Por ello, los programas para autónomos suelen centrarse en la facturación, el registro de ingresos y gastos y la previsión de impuestos como el IVA y el IRPF. El SII (Suministro Inmediato de Información del IVA) no es una obligación general de pymes y autónomos: según la AEAT, es obligatorio para los sujetos pasivos del IVA con periodo de liquidación mensual que estén inscritos en el REDEME, para las grandes empresas (facturación superior a 6.010.121,04 euros) y para los grupos de IVA.
Consulta con tu gestor o asesor qué obligaciones tienes en tu caso concreto.
¿Es mejor un software de contabilidad gratuito o de pago?
No se puede decir que una opción sea mejor que la otra, ya que todo depende de las necesidades del negocio. Los programas y planes gratuitos pueden ser una buena alternativa para autónomos o pequeñas empresas con requerimientos básicos, aunque a menudo incluyen limitaciones en funciones avanzadas, número de documentos o soporte técnico.
Por otro lado, las soluciones de pago ofrecen herramientas más completas, como la integración con bancos, la facturación electrónica y un soporte más amplio. Muchas permiten probar el software gratis durante un período determinado para evaluar si se ajusta a tus necesidades.
Los programas de contabilidad más usados en España
Una vez tengas tu check list particular y hayas definido las prestaciones que más te interesan, es el momento de estudiar las diversas ofertas del mercado y ponderar sus pros y contras. A continuación, nuestra selección.
Holded
Holded es un software de gestión en la nube popular entre pymes y autónomos digitales. Su plataforma integra, según el proveedor, contabilidad, facturación, CRM, gestión de proyectos e inventario, lo que permite administrar el negocio en un solo lugar.

Holded ofrece cinco planes (Plus, Básico, Estándar, Avanzado y Premium) y 14 días de prueba gratuita sin tarjeta. Según el proveedor, todos los planes incluyen facturación con Verifactu y dispone de app móvil para iOS y Android. Su interfaz moderna y su facilidad de uso lo hacen interesante para startups, autónomos y pymes digitales.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ Plataforma en la nube con acceso desde cualquier dispositivo | ✗ No tiene plan gratuito (solo prueba de 14 días) |
| ✓ Contabilidad, facturación, CRM e inventario en una sola herramienta | ✗ Requiere conexión a Internet |
| ✓ Verifactu en todos los planes, según el proveedor | ✗ Puede ser demasiado amplio para autónomos con necesidades básicas |
Quipu
Quipu es un programa de facturación y gestión de impuestos pensado para autónomos y pequeñas empresas. Actualmente forma parte del grupo TeamSystem. Ofrece tres planes (Starter, Solution y Premium) con pago mensual o anual y 15 días de prueba gratuita; según el proveedor, todos los planes están adaptados a Verifactu.
Quipu incluye en el plan Starter facturas y presupuestos ilimitados, previsión de impuestos y app móvil. La conciliación bancaria llega con el plan Solution.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ App móvil desde el plan Starter | ✗ Más enfocado a facturación que a contabilidad completa para sociedades |
| ✓ Verifactu en todos los planes, según el proveedor | ✗ Conciliación bancaria solo desde el plan Solution |
| ✓ Prueba gratuita de 15 días | ✗ No tiene plan gratuito |
Contasimple
Contasimple (en su web, “Contasimple by Shine”) es un programa en la nube para autónomos y pequeñas empresas que ofrece un plan gratuito Básico (con límite de 12 documentos al año) y los planes de pago Profesional y Ultimate, con pago trimestral o anual. Todos los planes incluyen app móvil. El plan Profesional incluye factura electrónica (FACe) y el Ultimate, factura electrónica avanzada. Según el proveedor, cumple con Verifactu; puedes probar 30 días el plan Ultimate sin tarjeta.
Contasimple permite empezar sin coste y pasar a un plan de pago cuando crece el volumen de facturas.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ Plan gratuito disponible | ✗ El plan gratuito está muy limitado en número de documentos |
| ✓ App móvil en todos los planes | ✗ Factura electrónica avanzada solo en el plan Ultimate |
| ✓ Prueba de 30 días del plan Ultimate | ✗ Sin pago mensual: solo trimestral o anual |
Anfix
Anfix es un programa en la nube de facturación, tesorería y gestión de impuestos para autónomos y pymes. Según el proveedor, todos los planes incluyen Veri*Factu y app móvil, con 15 días de prueba sin tarjeta. Ofrece cinco planes (de Básico a Premium) con pago mensual o anual, además de módulos opcionales como la gestión de stock o de proyectos.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ Verifactu y app móvil en todos los planes | ✗ Módulos de stock y proyectos con coste adicional |
| ✓ Plan de entrada económico | ✗ No tiene plan gratuito |
| ✓ Pago mensual o anual | ✗ Cinco planes: conviene comparar bien su contenido |
Billin (TS Facturas)
Billin, que en su web aparece como TS Facturas (TeamSystem), es una herramienta de facturación para autónomos y pequeñas empresas. Según el proveedor, todos los planes incluyen presupuestos, facturas, tickets, albaranes y proformas ilimitados, app móvil y gestión de stock, con 30 días de prueba gratuita y facturas electrónicas Verifactu y Facturae.
Billin ofrece tres planes (Básico, Pro e Ilimitado) que se diferencian sobre todo por el número de clientes, usuarios y documentos mensuales.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ Documentos ilimitados en todos los planes, según el proveedor | ✗ Pensado sobre todo para facturación, no es una contabilidad completa |
| ✓ App móvil y Facturae | ✗ El plan Básico se limita a 1 usuario y 5 clientes |
| ✓ Prueba de 30 días | ✗ No tiene plan gratuito |
Sage 50
Sage es un proveedor de software de gestión empresarial. Su solución Sage 50 está pensada, según el proveedor, para pymes y combina contabilidad, facturación y gestión comercial, con versión desktop y en la nube.

Sage 50 ofrece tres niveles (Essential, Standard y Premium): Essential, para microempresas con hasta 2 usuarios, incluye contabilidad básica y facturación; Standard añade analítica, modelos fiscales y conciliación bancaria. Está disponible en versión desktop y en la nube y, según el proveedor, tiene app móvil y viene adaptado de forma nativa a Verifactu. El precio de lista de entrada (plan Essential) corresponde a un contrato anual con pago anual y es superior al de las soluciones solo de facturación: consulta las condiciones actuales en la web de Sage.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ Acceso desde la nube y software de escritorio | ✗ Coste más elevado que otras soluciones |
| ✓ Tres niveles (Essential, Standard, Premium) y ediciones sectoriales | ✗ Puede resultar complejo para pequeños autónomos |
| ✓ App móvil y Verifactu, según el proveedor | ✗ Precio de lista con contrato anual |
Contasol
Contasol (TeamSystem Contasol) es el programa de contabilidad de TeamSystem | Software DELSOL, pensado para pequeñas empresas, autónomos y asesorías. Según el proveedor, puedes trabajar con tus datos en tu equipo (Windows) o en la nube.

Contasol gestiona, según el proveedor, la contabilidad, los impuestos (IVA, IRPF), la tesorería y las cuentas anuales. La web indica que está adaptado a Verifactu y que el SII es un módulo de contratación adicional. Hay 30 días de prueba gratuita y después se contrata una suscripción, mensual o anual. En la tabla comparativa, su categoría de precio corresponde a la opción local con soporte digital y renovación mensual.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ Instalación local o en la nube | ✗ Requiere suscripción tras la prueba |
| ✓ 30 días de prueba gratuita | ✗ No se indica app móvil |
| ✓ Adaptado a Verifactu, según el proveedor | ✗ SII solo como módulo adicional |
a3ERP Contabilidad
a3ERP Contabilidad es una solución de Wolters Kluwer. Según el proveedor, a3ERP es un software ERP para pymes que agrupa contabilidad, facturación, almacén y gestión de clientes. La empresa ofrece también otras soluciones (como a3factura o a3innuva ERP).

a3ERP Contabilidad: el proveedor no publica precios y la solución se contrata solo por cotización. Consulta además directamente con el proveedor la plataforma (local o nube), la versión de prueba, la app móvil y la compatibilidad con Verifactu, ya que no hemos podido confirmarlos en su web.
| Ventajas | Desventajas |
|---|---|
| ✓ Software ERP con contabilidad, facturación y almacén, según el proveedor | ✗ Precio y condiciones solo en consulta con el proveedor |
| ✓ Parte de una familia de soluciones a3 | ✗ Menos práctico para autónomos con necesidades sencillas |
- Escribe correos electrónicos perfectos con ayuda de la IA (opcional)
- Dominio gratis más asesor personal
- Protección contra virus y spam
Conclusión
Cada uno de estos programas tiene ventajas específicas dependiendo del tipo de negocio:
- Si quieres una plataforma moderna con facturación, contabilidad y CRM → Holded
- Si eres autónomo y buscas facturación e impuestos de forma sencilla → Quipu, Contasimple, Anfix o Billin
- Si quieres empezar sin coste → plan gratuito de Contasimple
- Si necesitas una solución con versión de escritorio y en la nube → Sage 50 o Contasol
- Si eres una asesoría o necesitas una solución profesional para pymes → a3ERP Contabilidad
Ten en cuenta que el software adecuado dependerá de las necesidades contables y operativas de cada empresa.
Preguntas frecuentes sobre programas de contabilidad, Verifactu y factura electrónica
Las respuestas resumen los puntos principales de esta comparativa (a octubre de 2026). Esta información es orientativa y no constituye asesoramiento fiscal; consulta a tu gestor o asesor.
¿Qué es Verifactu y a quién afecta?
Verifactu es el sistema derivado del Real Decreto 1007/2023 para los sistemas informáticos de facturación. Según el Real Decreto-ley 15/2025, los contribuyentes del Impuesto sobre Sociedades deben tener adaptados los sistemas antes del 1 de enero de 2027 y el resto de obligados, como los autónomos que tributan por IRPF por actividades económicas, antes del 1 de julio de 2027. El Ministerio de Hacienda publicó el 5 de octubre de 2026 una nota informativa sobre la previsión de aplazar las obligaciones pendientes hasta octubre de 2028; a 8 de octubre de 2026 no hemos encontrado su publicación en el BOE. Consulta la AEAT para conocer el estado actual.
¿Cuándo será obligatoria la factura electrónica entre empresas?
Según el Real Decreto 238/2026, doce meses después de la entrada en vigor de la Orden HAC/1028/2026 (6 de octubre de 2026) para quienes hayan superado los 8 millones de euros de volumen de operaciones en el año natural anterior, y veinticuatro meses después para el resto de empresarios y profesionales. Ni el real decreto ni la orden fijan fechas de calendario concretas; consulta la AEAT para conocer el estado actual.
¿Es obligatorio el SII para autónomos y pymes?
No con carácter general. Según la AEAT, el SII es obligatorio para los sujetos pasivos del IVA con periodo de liquidación mensual que estén inscritos en el REDEME, para las grandes empresas (facturación superior a 6.010.121,04 euros) y para los grupos de IVA. Consulta con tu gestor si te afecta.
¿Qué es Facturae?
Facturae es el formato estructurado de factura electrónica de la Administración española. Según Facturae.gob.es, las facturas dirigidas a las administraciones públicas deben ser electrónicas y ajustarse a este formato desde el 15 de enero de 2015. Algunos programas, como Contasimple o Billin, indican que lo admiten.
¿Cuánto tiempo debo conservar la contabilidad?
Según el artículo 30 del Código de Comercio, durante seis años a partir del último asiento realizado en los libros, salvo lo que se establezca por disposiciones generales o especiales. Para tu caso concreto, consulta a tu gestor o asesor.
¿Hay programas de contabilidad gratuitos?
Sí, por ejemplo, Contasimple ofrece un plan gratuito con un máximo de 12 documentos al año. Los planes gratuitos suelen tener limitaciones. Los precios y el contenido de los planes cambian, así que compruébalos en la web del proveedor.
¿Es mejor un programa en la nube o de instalación local?
Depende de tus necesidades: la nube ofrece acceso desde cualquier dispositivo y actualizaciones a cargo del proveedor; la instalación local da más control sobre los datos. Algunos programas, como Contasol y Sage 50, ofrecen ambas opciones.
Por favor, ten en cuenta el aviso legal relativo a este artículo.

